O SIGA contempla métodos de pagamento interativos, como o VISA e o Paypal, em que o pagamento é efetuado e registado no momento, e métodos como a referência MB, Boleto Bancário (PagSeguro Brasil), transferência bancária ou cash em que o pagamento é efetuado de forma diferida.
Com exceção da transferência bancária/cash, os métodos não interativos como a referência MB ou o PagSeguro permitem que o registo do pagamento seja efetuado de forma automática.
A gestão de pagamentos do SIGA apresenta as seguintes funcionalidades:
Controlo de Pagamentos: é possível definir uma taxa de candidatura e um valor de inscrição para cada edição de curso e dar a escolher ao candidato entre os métodos de pagamento disponíveis;
Descontos e Vouchers: é possível definir descontos especiais, em percentagem ou valor, aplicados automaticamente a candidaturas que respeitam determinadas condições. O sistema pode ainda emitir vouchers eletrónicos que permitem usufruir de um desconto através da introdução do código do voucher no formulário de candidatura/inscrição;
Planos de Pagamento: é possível configurar e disponibilizar no formulário de candidatura diversos planos de pagamento da inscrição no curso, como alternativa ao pronto pagamento. Neste caso, o sistema emitirá automaticamente avisos de pagamento por e-mail ou SMS, com os respetivos dados, à medida que estes ficam disponíveis para pagamento.